10种石斑鱼系统发育的线粒体细胞色素b基因序列分析   总被引：8，自引：1，他引：8  

陈艺燕  章群  任岗  钱开诚  陈迪  许忠能 《海洋科学》2006,30(6):12-15

为探讨石斑鱼亚科鱼类的系统发育关系,测定了此亚科中具有代表性的石斑鱼属、鳃棘鲈属、九棘鲈属、驼背鲈属和白线光腭鲈属等5个属10种石斑鱼的细胞色素b基因全序列,分析了这些序列的特性,运用Kimura 2-parameter模型,以邻接法构建了分子系统树。结果表明,九棘鲈属与鳃棘鲈属位于系统进化树的基部,与石斑鱼类其它类群亲缘关系较远;驼背鲈属与白线光腭鲈属网结于石斑鱼属构成的分支中。  相似文献   

Diagnosis of iridovirus in large yellow croaker by PCR   总被引：1，自引：0，他引：1  

Chen Xinhu  Wang Xiaowen  Wu Wenzhong 《海洋学报(英文版)》2003,22(4):635-642

A rapid and sensitive PCR-based method for the detection of the large yellow croaker iridovirus(LYCIV) is described,which involves the amplification of a 295 bp fragment of the LYCIV ATPase gene from DNA isolated from naturally infected fish spleen.Sequencing of LYCIV ATPase gene fragment showed it shared 100% nucleotide sequence homology with the corresponding region of the ATPase gene of red sea bream iridovirus(RSIV) and sea bass iridovirus(SBIV),suggesting that LYCIV was homologous with RSIV and SBIV at least in part of the gemone.The specificity and sensitivity of the PCR procedure were tested on the iridovirus-infected fishes,the expected fragment was detected from spleen DNA samples of infected fishes,whereas no fragments were amplified from healthy fish spleen DNA,white spot syndrome baculoviruses(WSBV) DNA and pseudorabies virus(PRV) DNA.Detection limit of this method was 10^-7 ng positive plasmid DNA containing target sequence,equal to about 100 virions.In the infected experiment,first positive detection(1/4) appeared at Day 3 post-infection,all fish(4/4) tested positive at Day 7,however obvious symptoms were observed at Day 8,so LYCIV infection could be detected prior to the appearance of obvious symptoms.These results indicate that this PCR method could be used for early,rapid and specific detection of LYCIV infection.  相似文献   

耳鲍(Haliotis asinina)核糖体小亚基(18S rRNA)编码基因的克隆与序列分析   总被引：1，自引：0，他引：1       下载免费PDF全文

黄勃  方再光  刘均玲  周智  王小兵 《海洋与湖沼》2007,38(3):212-216

采用分子生物学的方法,对南海不同海区的两个地理群体耳鲍(Haliotis asinina)18S rRNA基因全长进行了克隆和序列分析,并将耳鲍18S rRNA基因的序列与NCBI数据库中已收录鲍的18SrRNA基因进行了比较。结果发现,南海耳鲍核糖体18S rRNA基因与耳鲍H.asinina isolate H11核糖体18S rRNA基因序列的相同率高达98%;同一地理群体内耳鲍核糖体18S rRNA基因序列完全一致;不同地理群体间耳鲍核糖体18S rRNA基因在碱基组成上的相似率为99%,仅在某些位点处发生了碱基替换,即腺嘌呤(T)被鸟嘌呤(G)替换;同时,将这两个不同群体中耳鲍的18S rRNA基因与泰国耳鲍18S rRNA基因序列进行比较分析发现,它们之间也只是发生了碱基替换。  相似文献   

中国花鲈细胞色素b基因片段的序列研究(英文)     

高天翔  张秀梅  陈大刚  张美昭  任一平  张亚平 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2001,31(2)

参考鳗鲡等鱼类线粒体 DNA序列进行了中国花鲈线粒体 DNA细胞色素 b基因片断的引物设计、PCR扩增及其序列测定。得到中国花鲈的碱基序列为 4 10 bp,其 A、T、G、C含量分别为 10 1bp(2 4 .6 3% )、112 bp(2 7.32 % )、72 bp(17.56 % )、12 5bp(30 .4 9% ) ,与鳗鲡等其他鱼类相同基因片断序列碱基含量相似。  相似文献   

马氏珠母贝家系的生长比较   总被引：12，自引：0，他引：12  

何毛贤  管云雁  林岳光  黄良民 《热带海洋学报》2007,26(1):39-43

采用单对配对方法建立马氏珠母贝Pinctada martensii第一代家系7个,对家系间的生长和家系内大小变异进行了分析比较。7个家系的壳高大小顺序为F15>F20>F18>F19>F12>F17>F21,总重大小顺序为F15>F18>F19>F20>F12>F17>F21。在同批家系中,F15的壳高、总重显著大于其它2个家系(F12、F17)(p<0.05),其壳高比F12大11.64%,比F17大16.01%;其总重比F12重27.40%,比F17重38.98%,而且其个体大小变异较小,表现出明显的生长优势,是一个生长性状优良的家系。F18在壳高和总体重上比F19大2.88%和19.49%。F20显著大于F21(p<0.05),壳高比F21大19.49%,总重大53.72%,该家系生长较快,可通过进一步的选择培育成一个生长快、个体大的家系。  相似文献   

3种蛏类线粒体16SrRNA和COI基因片段的序列比较及其系统学初步研究   总被引：15，自引：0，他引：15  

陈丽梅  孔晓瑜  喻子牛  于珊珊  徐晖 《海洋科学》2005,29(8):27-32

对3种蛏类大竹蛏（Solen grandis），长竹蛏（Solen strictus）和小刀蛏（Cultellus attenuatus）的线粒体16SrRNA和COI基因片段序列进行了比较并对其系统学进行了初步研究。得到的序列总长度分别为472-481bp（16S）和658bp（COI）。3种蛏序列的碱基组成均显示出较高的A＋T比例（16SrRNA基因62．1％；COI基因62．8％）。对位排序比较表明，16SrRNA片段种内个体间变异较小，3种类间存在128个碱基变异位点（其中包括127个简约信息位点）和5个插入／缺失位点，总共12个碱基长；COI片段有200个碱基存在变异，其中包括191个简约信息位点，不存在任何插入／缺失位点。数据分析结果表明16SrRNA和COI基因片段大竹蛏与长竹蛏两片段的遗传距离分别为0．0856和0．1712，两竹蛏类与小刀蛏的遗传距离分别为0．3054，0．2798和0．2662，0．2933。作者认为小刀蛏与竹蛏之间的遗传距离已达到科之间的水平，结果支持将其提升为刀蛏科的分类观点。3种蛏类线粒体16SrRNA和COI基因在种间明显的多态性，证实了16SrRNA和COI基因序列均普遍适用于蛏类种及以上阶元的系统学分析。  相似文献   

最小弧菌热不稳定型溶血素基因克隆与序列分析     

李涛  吴后波 《台湾海峡》2006,25(3):324-329

根据已发表的最小弧菌热不稳定型溶血素（heat-labile hemolysin）基因核苷酸序列，设计和合成一对特异性引物，以最小弧菌96-6-3的基因组DNA为模板，PCR扩增得到热不稳定型溶血素基因片段，克隆到质粒载体pMD-18T中进行测序和分析．其结果表明扩增的热不稳定型溶血素基因片段与已发表的最小弧菌热不稳定型溶血素的同源性高达98％，扩增片段编码由446个氨基酸组成的多肽，推测分子量为50200．软件分析表明编码的氨基酸有较高的抗原性，可作为基因工程疫苗的候选基因片段．  相似文献   

转“全鱼”溶菌酶基因大菱鲆的研究   总被引：7，自引：0，他引：7  

纪伟  张培军 《海洋科学》2004,28(5):8-14

用大西洋条鳕(Macrozoarces americanus)抗冻蛋白启动子opAFP promoter和牙鲆(Paralichthys olivaceus)c型溶菌酶基因构建“全鱼”溶菌酶基因元件opAFP—ly，首次应用电脉冲精子介导法将该基因片段导入到大菱鲆(Scophthalmus maximus)受精卵内，获得原代转基因大菱鲆。先后采用单因子方法和正交实验方法，重复实验确定了最适导入条件：脉冲电压为400V／cm，脉冲次数为5，脉冲宽度为25ms，外源DNA浓度为50mg/L。利用最适导入条件，实现基因元件大规模转移。采用PCR技术对1月龄的原代转基因大菱鲆仔鱼的染色体DNA进行分析，结果表明外源基因的整合率可达28％。  相似文献   

兰坪坳陷油气组群特征及其成因   总被引：2，自引：0，他引：2  

常象春  郭海花  张金亮 《西北地质》2004,37(2):69-74

兰坪坳陷的油气主要见于金顶矿区的下含矿层，储层主要为上三叠统三合洞组的灰岩和角砾状灰岩。油气地球化学特征表明有机母源输入是多源的，沉积成烃水体介质以还原性占优势．具有较高盐度，有机质热演化处于成熟一高成熟阶段．生物降解改造较为强烈。根据原油的母源贡献、生物降解、环境介质条件等特征，将兰坪坳陷原油划分为3类组群。  相似文献   

When the Light of the Home is Abroad: Unskilled Female Migration and the Filipino Family     

Maruja Milagros B. Asis  Shirlena Huang  Brenda S.A. Yeoh 《Singapore journal of tropical geography》2004,25(2):198-215

The migration of women engaged in transnational domestic work reveals how the uneven impacts of globalisation have intruded into the micro‐world of families and households. In this age of globalisation and migration, family membership has become multisited or transnational, with members dispersed in space. The migration of workers and the separation this entails has raised challenges to notions and ideals of “being family”. Unlike other workers on the move, the migration of domestic workers has some distinctive characteristics. It can be framed in terms of women moving between families and households; workers whose departure from their family of origin and insertion into their family of employment reconstitute the structure and content of family relationships in both material and imagined ways. Drawing on in‐depth interviews conducted in the Philippines and Singapore, we explore how migrant women and their family members define and negotiate family ideals, gender identities and family relationships, given the family's transnational configuration. Our findings provide some support to the notion that individual members in transnational families resort to “relativising” in fashioning responses to their situation.  相似文献